La mayor parte de la correspondencia del s. XIX estaba apilada sin orden en el depósito, junto con documentos de los ss. XVIII y XX. Para comenzar el proceso de organización archivística con esos documentos se procedió a separarlos por siglos. Posteriormente, los del s. XIX se ordenaron cronológicamente y se asignaron a cada secretario en función del periodo de su mandato. Se identificaron algunos documentos que procedían de los expedientes de distintos académicos, que se integraron en ellos.